MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 6796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020833	AC	3	6	295323	295328	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_020833	G	6	6	295383	295388	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_020833	CCT	2	6	295464	295469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_020833	CA	3	6	295499	295504	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_020833	ATGA	2	8	295518	295525	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_020833	GA	3	6	295524	295529	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_020833	TGT	2	6	295635	295640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_020833	CGG	2	6	295677	295682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_020833	GAT	2	6	295721	295726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_020833	TCT	2	6	295735	295740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_020833	GA	3	6	295775	295780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_020833	A	6	6	295849	295854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_020833	T	7	7	295907	295913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_020833	GAA	2	6	296004	296009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_020833	GAA	2	6	296093	296098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_020833	CTA	2	6	296100	296105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_020833	TG	3	6	296126	296131	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_020833	TAG	2	6	296196	296201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_020833	GCGA	2	8	296204	296211	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_020833	AAC	2	6	296322	296327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_020833	G	6	6	296364	296369	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_020833	TCC	2	6	296374	296379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_020833	GGA	2	6	296683	296688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_020833	AC	3	6	296900	296905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_020833	GGTG	2	8	296906	296913	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_020833	AAC	2	6	296937	296942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_020833	AGC	2	6	297027	297032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_020833	AAAG	2	8	297041	297048	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_020833	AGTCG	2	10	297063	297072	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1030	NC_020833	CTG	2	6	297186	297191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_020833	TAA	2	6	297364	297369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_020833	AGGTT	2	10	297390	297399	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_020833	TGA	2	6	297476	297481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_020833	TTA	2	6	297545	297550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_020833	GGT	2	6	297575	297580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_020833	GA	3	6	297605	297610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_020833	GCTG	2	8	297718	297725	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_020833	TTA	2	6	297733	297738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_020833	TGCC	2	8	297785	297792	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_020833	CGG	2	6	297857	297862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_020833	ATG	2	6	297933	297938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_020833	TGAAAT	2	12	297966	297977	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_020833	ACC	2	6	298128	298133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_020833	TGG	2	6	298188	298193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_020833	TCC	2	6	298214	298219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_020833	GGA	2	6	298231	298236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_020833	AAGC	2	8	298290	298297	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_020833	GACA	2	8	298308	298315	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_020833	GGT	2	6	298351	298356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_020833	CGG	2	6	298438	298443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_020833	TCA	2	6	298466	298471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_020833	CGT	2	6	298546	298551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_020833	GCT	2	6	298600	298605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_020833	GT	3	6	298754	298759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_020833	GTT	2	6	298764	298769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_020833	ACG	2	6	298777	298782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_020833	GT	3	6	298795	298800	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_020833	GAA	3	9	298894	298902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_020833	AGA	2	6	298912	298917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_020833	AATC	2	8	298918	298925	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_020833	CGA	2	6	299019	299024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_020833	GTG	2	6	299095	299100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_020833	TCG	2	6	299124	299129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_020833	TTTAA	2	10	299133	299142	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1067	NC_020833	GCC	2	6	299238	299243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_020833	T	6	6	299261	299266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_020833	GTT	2	6	299267	299272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_020833	GGTAAA	2	12	299275	299286	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_020833	A	6	6	299284	299289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_020833	GTT	2	6	299351	299356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_020833	T	7	7	299355	299361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_020833	T	6	6	300907	300912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_020833	A	6	6	301419	301424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_020833	ATAA	2	8	302251	302258	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_020833	TG	3	6	302803	302808	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_020833	ATT	2	6	302810	302815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_020833	AGAT	2	8	302829	302836	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_020833	GA	3	6	302910	302915	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_020833	TGA	2	6	305565	305570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_020833	ATAAA	2	10	305571	305580	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_020833	CTA	2	6	305603	305608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1085	NC_020833	T	6	6	305620	305625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_020833	TGG	2	6	305657	305662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_020833	GCT	2	6	305705	305710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_020833	TGG	2	6	305754	305759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_020833	GCT	2	6	305802	305807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_020833	TGG	2	6	305852	305857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_020833	GCT	2	6	305900	305905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_020833	TAT	2	6	306124	306129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1097	NC_020833	GTT	2	6	312586	312591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_020833	T	6	6	312595	312600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_020833	CCA	2	6	312676	312681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_020833	TAGT	2	8	312773	312780	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_020833	AAT	2	6	312800	312805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_020833	TTGTT	2	10	312809	312818	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_020833	TAG	2	6	312897	312902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_020833	TTATTT	2	12	312909	312920	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_020833	T	6	6	312940	312945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_020833	GGT	2	6	314464	314469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_020833	ATA	3	9	314485	314493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_020833	AGCC	2	8	314633	314640	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_020833	TTA	2	6	314672	314677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_020833	A	6	6	314700	314705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_020833	CCA	2	6	314779	314784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_020833	AGC	2	6	314800	314805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_020833	TAAAG	2	10	314845	314854	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_020833	AAGAG	2	10	314866	314875	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_020833	TGA	2	6	314877	314882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_020833	TTA	2	6	314995	315000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_020833	TGT	2	6	315013	315018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_020833	AAC	2	6	315044	315049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_020833	A	6	6	315058	315063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_020833	AT	3	6	315098	315103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_020833	GAT	2	6	317162	317167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_020833	TTA	2	6	317168	317173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_020833	GACT	2	8	317233	317240	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1124	NC_020833	ATT	2	6	317246	317251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_020833	AAAAAC	2	12	317263	317274	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1126	NC_020833	TCA	2	6	317282	317287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_020833	A	6	6	319247	319252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_020833	A	6	6	319356	319361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_020833	A	6	6	319947	319952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_020833	TCA	2	6	319961	319966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_020833	AAT	2	6	320998	321003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_020833	ATTT	2	8	321025	321032	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_020833	ACA	2	6	321038	321043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_020833	GTT	2	6	321102	321107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1136	NC_020833	GGT	2	6	321151	321156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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